Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEDD1Q8NHV4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD1Q8NHV4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms