Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
IGSF1Q8N6C5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms