Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HDXQ7Z353 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms