Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms