Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HECW1Q76N89 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms