Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM5Q71RC9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM5Q71RC9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms