Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00299Q6ZSB3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms