Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CCDC141Q6ZP82 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC141Q6ZP82 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms