Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMARCD3Q6STE5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms