Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms