Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
LINC01545Q5VT33 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms