Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HES3Q5TGS1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms