Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
KLHL22Q53GT1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLHL22Q53GT1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms