Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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RRN3P1Q2M238 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RRN3P1Q2M238 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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