Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC142Q17RM4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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