Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NEDD8Q15843 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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NEDD8Q15843 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NEDD8Q15843 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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