Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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