Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CDSNQ15517 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDSNQ15517 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDSNQ15517 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDSNQ15517 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDSNQ15517 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CDSNQ15517 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CDSNQ15517 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CDSNQ15517 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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