Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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SYCP1Q15431 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYCP1Q15431 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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