Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms