Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PUM3Q15397 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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PUM3Q15397 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PUM3Q15397 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PUM3Q15397 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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PUM3Q15397 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PUM3Q15397 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PUM3Q15397 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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