Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SRCIN1-212ENST00000613927 1150 ntTSL 315.05■□□□□ -02e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MLX-206ENST00000588320 2313 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NDUFA7-202ENST00000593729 569 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SCLY-208ENST00000433750 660 ntTSL 214.55□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABCF3-206ENST00000466742 2331 ntTSL 214.53□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 AAAS-205ENST00000546572 582 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NDUFA7-204ENST00000601101 414 ntTSL 414.23□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-203ENST00000448549 582 ntTSL 414.23□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 LINC01006-206ENST00000447933 766 ntTSL 314.13□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-209ENST00000430276 896 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-205ENST00000589069 582 ntTSL 213.87□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 GATS-210ENST00000538588 557 ntTSL 413.83□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ABCF3-210ENST00000473311 2844 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.256e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MLX-207ENST00000590050 2537 ntTSL 213.1□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-224ENST00000512157 734 ntTSL 512.83□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BICDL1-209ENST00000548673 1109 ntTSL 212.81□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-206ENST00000589591 542 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 RUNX1-213ENST00000469087 1790 ntTSL 1 (best)12.5□□□□□ -0.413e-12■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MECP2-210ENST00000488293 1198 ntTSL 512.44□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MECP2-206ENST00000460227 1298 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.463e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ACTN1-207ENST00000553290 619 ntTSL 512.11□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BICDL1-205ENST00000546790 555 ntTSL 412.07□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-232ENST00000515783 962 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 TRA2A-209ENST00000494255 1653 ntTSL 1 (best)11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DUS3L-214ENST00000592673 701 ntTSL 211.91□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-215ENST00000452261 769 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ACTN1-206ENST00000544964 891 ntTSL 511.86□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-207ENST00000434675 2001 ntTSL 211.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IQGAP3-203ENST00000491900 5294 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-202ENST00000585842 368 ntTSL 211.66□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-208ENST00000454083 597 ntTSL 311.48□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SLC45A3-201ENST00000367145 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-12■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-210ENST00000432589 210 ntTSL 311.36□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NDUFA7-201ENST00000301457 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-205ENST00000507342 359 ntTSL 311.21□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 AL359736.1-201ENST00000382141 4157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 POLR2I-207ENST00000592962 493 ntTSL 211.04□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-213ENST00000506507 4532 ntTSL 511.03□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BMS1P4-201ENST00000441263 1332 ntBASIC11.03□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 MECP2-207ENST00000463644 1088 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-220ENST00000509815 422 ntTSL 510.9□□□□□ -0.662e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ITFG2-AS1-201ENST00000540093 630 ntTSL 310.47□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 ELF3-203ENST00000367284 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-204ENST00000367572 2496 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-201ENST00000361183 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DQX1-203ENST00000418139 1688 ntTSL 510.15□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-210ENST00000504021 3541 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.82e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BMS1P4-203ENST00000580790 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-203ENST00000367571 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.822e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SON-215ENST00000475072 658 ntTSL 29.86□□□□□ -0.832e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 EPB41L1-208ENST00000427533 460 ntTSL 39.79□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-204ENST00000526530 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-215ENST00000507564 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 NDUFA7-203ENST00000595856 553 ntTSL 59.57□□□□□ -0.882e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 BICDL1-210ENST00000550197 514 ntTSL 49.48□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DQX1-206ENST00000483555 832 ntTSL 39.46□□□□□ -0.92e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 VPS39-214ENST00000614932 2835 nt9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAG1-202ENST00000423799 1684 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.916e-7■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-225ENST00000512220 4057 ntTSL 29.33□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-216ENST00000612355 936 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 LINC01006-203ENST00000425712 661 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 VPS39-205ENST00000562258 4160 ntTSL 29.02□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 IFT122-201ENST00000296266 4151 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.992e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-219ENST00000457031 1136 ntTSL 28.77□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CAPZA2-206ENST00000461878 621 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.012e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 CARF-201ENST00000320443 5209 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 DERA-210ENST00000533447 819 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PPARGC1A-211ENST00000513205 1432 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 23.1
PCBP2Q15366 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.052e-6■■■■□ 23.1
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