Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECTIN1Q15223 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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