Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms