Protein–RNA interactions for Protein: Q14677

CLINT1, Clathrin interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLINT1Q14677 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CLINT1Q14677 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
CLINT1Q14677 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms