Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SHROOM2Q13796 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms