Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLAMF1Q13291 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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