Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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SEMA3BQ13214 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA3BQ13214 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SEMA3BQ13214 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SEMA3BQ13214 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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