Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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BNIP1Q12981 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BNIP1Q12981 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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