Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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NPRL3Q12980 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPRL3Q12980 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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NPRL3Q12980 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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