Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPN13Q12923 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms