Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SCAPQ12770 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SCAPQ12770 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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