Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TLE4Q04727 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TLE4Q04727 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms