Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IRF8Q02556 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms