Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA1DQ01668 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms