Protein–RNA interactions for Protein: Q01546

KRT76, Keratin, type II cytoskeletal 2 oral, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT76Q01546 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRT76Q01546 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRT76Q01546 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms