Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
MS4A2Q01362 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MS4A2Q01362 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms