Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms