Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EEF1A1P68104 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms