Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAD23AP54725 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms