Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ARFIP2P53365 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ARFIP2P53365 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms