Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTGIRP43119 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms