Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GJC1P36383 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GJC1P36383 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms