Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms