Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GJA4P35212 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GJA4P35212 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms