Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms