Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPL9P32969 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RPL9P32969 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms