Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXC12P31275 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms