Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMA3P25788 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMA3P25788 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms