Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PTPRBP23467 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PTPRBP23467 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRBP23467 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRBP23467 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PTPRBP23467 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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